Biologi kimia (April 2020)

Penghambatan alosterik hipoksia inducible factor-2 dengan molekul kecil

Penghambatan alosterik hipoksia inducible factor-2 dengan molekul kecil

Subjek Biokimia Biofisika Kanker Alat kimia Penyaringan throughput tinggi Molekul kecil Abstrak Hypoxia inducible factor (HIFs) adalah faktor transkripsi heterodimerik yang diinduksi pada banyak kanker di mana mereka sering mempromosikan ekspresi jalur protumorigenik. Meskipun faktor-faktor transkripsi biasanya dianggap 'tidak dapat dilumpuhkan', domain PAS-B dari subunit HIF-2α mengandung rongga besar di dalam inti hidrofobiknya yang menawarkan pijakan unik untuk pengaturan molekul kecil.

Siklus muatan kiral

Siklus muatan kiral

Subjek Mekanisme reaksi Sintesis kimia Angew. Chem Int. Ed. 51 , 1248–1251 (2012) Reaksi domino menawarkan akses mudah ke arsitektur molekul yang kompleks, seringkali dengan kontrol stereokimia yang indah. Shi et al . memberikan contoh yang elegan dari pendekatan ini dalam reaksi cycloaddition [2 + 2 + 2] baru yang menggabungkan reaksi Michael dan Henry untuk mengakses produk cyclohexane dengan substituen yang ditentukan secara stereokimia pada setiap cincin karbon.

Inteins tersembunyi

Inteins tersembunyi

Subjek Kerusakan dan perbaikan DNA Mekanisme enzim Modifikasi pasca-terjemahan Prediksi struktur protein Asam Nukleat Res. doi: 10.1093 / nar / gkv612 Intein adalah elemen penyambungan diri yang mengeluarkan diri dari protein yang diterjemahkan untuk meninggalkan extein, atau protein matang. Mayoritas residu yang secara fungsional relevan dianggap internal ke intein, meskipun beberapa residu dalam urutan extein yang berbatasan langsung dengan intein telah terbukti mempengaruhi fungsi

Informasi Minimum tentang kluster Gen Biosintetik

Informasi Minimum tentang kluster Gen Biosintetik

Subjek Biosintesis Produk alami Anotasi urutan Biologi sintetis Berbagai macam jalur enzimatik yang menghasilkan metabolit khusus pada bakteri, jamur dan tanaman diketahui dikodekan dalam kelompok gen biosintetik. Informasi tentang klaster, jalur, dan metabolit ini saat ini tersebar di seluruh literatur, sehingga sulit untuk dieksploitasi

Memobilisasi peptida dalam kekebalan

Memobilisasi peptida dalam kekebalan

Subjek Imunologi Peptida Memanfaatkan sistem kekebalan tubuh untuk mengobati penyakit akan difasilitasi oleh pemahaman yang lebih besar tentang asal-usul dan peran peptida dalam kekebalan. Telah diketahui selama lebih dari 30 tahun bahwa peptida adalah faktor penting dalam memobilisasi sistem kekebalan terhadap penjajah asing

Erratum: Aktivitas aminoglikosida diamati pada kompleks ribosom pra-translokasi tunggal

Erratum: Aktivitas aminoglikosida diamati pada kompleks ribosom pra-translokasi tunggal

Subjek Mekanisme aksi Ribosome Biologi struktural tRNA Artikel asli diterbitkan pada 29 November 2009 Nat. Chem Biol. 6 , 54-62 (2010); diterbitkan online 29 November 2009; dikoreksi setelah cetak 12 Februari 2010 Dalam versi artikel ini yang awalnya diterbitkan, pada kunci untuk Gambar 6a, unit untuk dua konsentrasi inhibitor secara keliru diberi label sebagai "M", di mana mereka seharusnya membaca "μM".

Erratum: Wawasan ke mucopolysaccharidosis I dari struktur dan aksi α- L -iduronidase

Erratum: Wawasan ke mucopolysaccharidosis I dari struktur dan aksi α- L -iduronidase

Subjek Biologi kimia Gangguan metabolisme Biologi struktural Artikel asli diterbitkan pada 11 September 2013 Nat. Chem Biol. ; doi: 10.1038 / nchembio.1357; dikoreksi online 20 September 2013 Dalam versi artikel ini yang awalnya diterbitkan secara online, di bagian metode “Sintesis IDUA inhibitor, ” dua nama kimia yang berbeda diberikan untuk 5F-IdoAF, dan nama lengkap untuk 2F-IdoAF secara tidak sengaja dihilangkan. Se

Corrigendum: Pencitraan molekuler hidrogen peroksida yang diproduksi untuk pensinyalan sel

Corrigendum: Pencitraan molekuler hidrogen peroksida yang diproduksi untuk pensinyalan sel

Artikel asli diterbitkan pada 01 April 2007 Biologi Kimia Alam 3 , 263-267 (2007); diterbitkan online 1 April 2007; dikoreksi setelah cetak 3 Mei 2007 Dalam versi artikel ini yang awalnya diterbitkan, nama belakang penulis kedua salah eja. Nama penulis harus membaca Orapim Tulyathan. Kesalahan telah diperbaiki dalam versi HTML dan PDF artikel

Corrigendum: Pemrograman ulang reversibel berbasis molekul kecil dari masa hidup sel

Corrigendum: Pemrograman ulang reversibel berbasis molekul kecil dari masa hidup sel

Biologi Kimia Alam 2 , 369-374 (2006); diterbitkan online 11 Juni 2006; dikoreksi setelah dicetak 22 Desember 2006 Dalam versi artikel ini yang awalnya diterbitkan, tidak ada kepentingan finansial yang bersaing yang diumumkan. Para penulis sekarang menyatakan bahwa mereka memiliki kepentingan bersaing yang mungkin dianggap mempengaruhi hasil dan diskusi yang dilaporkan dalam makalah ini, yang dirinci dalam deklarasi kepentingan keuangan yang bersaing yang menyertai artikel

Corrigendum: Modulator sambungan SMN2 meningkatkan asosiasi U1-pre-mRNA dan menyelamatkan tikus-tikus SMA

Corrigendum: Modulator sambungan SMN2 meningkatkan asosiasi U1-pre-mRNA dan menyelamatkan tikus-tikus SMA

Artikel asli diterbitkan pada 01 Juni 2015 Nat. Chem Biol. 11 , 511–517 (2015); diterbitkan online 1 Juni 2015; dikoreksi online 15 Juli 2015 Para penulis lupa untuk menyertakan deskripsi pengukuran kadar protein SMN dalam sampel jaringan dalam Metode Online. Deskripsi ini telah disertakan dalam versi HTML dan PDF artikel.

Menangkap kooperatif

Menangkap kooperatif

Mempertimbangkan definisi umum dan mekanisme perilaku kooperatif dapat menyebabkan wawasan baru ke dalam fungsi kimia dan biologis. Kooperatititas dikenal sebagai basis energetik untuk berbagai peristiwa mikroskopis, seperti chelation simultan ion logam, koordinasi temporal pelipatan protein dan fungsi terpadu dari kumpulan biomolekul

Sebuah rejeki nomplok untuk RNA

Sebuah rejeki nomplok untuk RNA

Dua hadiah Nobel 2006 mencerminkan peran sentral RNA dalam regulasi gen dan menekankan interaksi timbal balik dalam penemuan kimia dan biologi. RNA telah tampil menonjol dalam serangkaian penemuan inovatif baru-baru ini. Pada bulan Desember 2006, komite Nobel mengakui dua kemajuan seperti itu dengan memberikan Hadiah Nobel dalam Kimia kepada Roger Kornberg untuk karyanya dalam menjelaskan mekanisme molekuler transkripsi RNA dan Hadiah Nobel dalam Fisiologi atau Kedokteran untuk Craig Mello dan Andrew Fire atas penemuan mereka

Corrigendum: Dynamics menghubungkan pengenalan substrat dengan katalisis protein kinase A

Corrigendum: Dynamics menghubungkan pengenalan substrat dengan katalisis protein kinase A

Subjek Mekanisme enzim Kinase Konformasi molekul Artikel asli diterbitkan pada 03 Oktober 2010 Nat. Chem Biol. 6 , 821–828 (2010); diterbitkan online 3 Oktober 2010; dikoreksi setelah dicetak 18 April 2011 Dalam versi artikel ini yang awalnya diterbitkan, penulis salah mengakui pendanaan dari US National Institutes of Health, GM64742.

Komentar yang menarik

Komentar yang menarik

Subjek Biologi kimia Penerbitan Para ilmuwan harus penuh perhatian untuk memastikan integritas catatan yang diterbitkan dan menemukan cara baru untuk memfasilitasi debat ilmiah di era elektronik. Di era pelaporan terkini dan jejaring sosial kami, penemuan-penemuan ilmiah yang baru diterbitkan — terutama yang muncul di jurnal profil tinggi — menjangkau khalayak ilmiah yang lebih luas dan masyarakat umum dengan efisiensi yang lebih besar. Na

Erratum: Retikulum endoplasma Ca2 + meningkat meningkatkan proteostasis glucocerebrosidase mutan

Erratum: Retikulum endoplasma Ca2 + meningkat meningkatkan proteostasis glucocerebrosidase mutan

Subjek Pensinyalan kalsium Retikulum endoplasma Penyakit metabolik Artikel asli diterbitkan pada 09 Mei 2010 Nat. Chem Biol. 6 , 424-432 (2010); diterbitkan online 9 Mei 2010; dikoreksi setelah cetak 21 Mei 2010. Dalam versi artikel ini yang awalnya diterbitkan, salah satu garis sel yang digunakan keliru diberi penunjukan mutan L444P mengacu pada Gambar 6a, dan garis sel lain tidak termasuk penunjukan ini mengacu pada Gambar Tambahan 11 a, b

Mata terbuka lebar

Mata terbuka lebar

Memahami bagaimana fungsi protein dalam isolasi dan dalam konteks asli mereka membutuhkan penggabungan teknik tingkat molekuler yang mengeksplorasi interaksi struktur protein dan dinamika. Konsep 'satu gen, satu enzim' dan 'struktur menentukan fungsi' adalah prinsip dasar biokimia modern

Corrigendum: Memerangi penyakit neurodegeneratif dengan probe kimia dan sistem model

Corrigendum: Memerangi penyakit neurodegeneratif dengan probe kimia dan sistem model

Subjek Model biologis Biologi kimia Penyakit neurodegeneratif Terapi Nat. Chem Biol. 10 , 911-920 (2014); diterbitkan online 17 Oktober 2014; dikoreksi setelah cetak 11 Desember 2014 Dalam versi makalah ini awalnya diterbitkan, entri 'fase' untuk PBT2 pada Tabel 1 secara tidak sengaja diberi label sebagai 'Dihentikan'

Mempersempit target yang sebenarnya

Mempersempit target yang sebenarnya

Subjek Genetika kimia Proteomik Identifikasi target Banyak inhibitor kinase untuk terapi kanker agak non-selektif, dan mekanisme aksi sel mereka tidak sepenuhnya dipahami. Proteomik kimia bersarang dan strategi genetika kimia mengungkapkan target seluler mana dari dasatinib inhibitor klinis kinase yang secara fungsional terkait dengan aktivitas anti-onkogeniknya

Membuat data berfungsi

Membuat data berfungsi

Subjek Database Genomik Komunitas ilmiah Penggunaan set data ekstensif secara optimal yang dihasilkan di era pasca-genomik akan membutuhkan standar yang jelas dan komitmen untuk membuka komunikasi. Ahli kimia dan ahli biologi secara tradisional telah memajukan sains dengan mendefinisikan sistem tertentu yang menarik, merumuskan model untuk bagaimana sistem bekerja dan menguji model-model ini pada peningkatan level resolusi molekuler

Garis bawah

Garis bawah

Dukungan pendanaan yang ditingkatkan dan peningkatan keterlibatan ahli biologi kimia dalam proses pendanaan sangat penting untuk kemajuan lapangan. Di saat-saat terbaik, para ilmuwan akademis menghadapi tantangan dalam memperoleh dana untuk mendukung upaya penelitian independen mereka. Ini bukan waktu terbaik

Apa yang ada di ulasan?

Apa yang ada di ulasan?

Subjek Biologi kimia Ulasan rekan Wasit ilmiah menerima peran penting dalam proses peer review. Apa yang kita harapkan dari peninjau Biologi Kimia Alam ? Peer review tetap menjadi mekanisme utama untuk mempertahankan standar tinggi dan memastikan kelengkapan dan keakuratan studi ilmiah. Ini juga memberikan umpan balik praktis kepada penulis, yang mengarah ke makalah yang lebih baik dalam literatur ilmiah

Menemukan diri sendiri

Menemukan diri sendiri

Subjek Penerbitan Memastikan bahwa pencapaian dan minat riset Anda dapat diakses secara online memperluas jangkauan karya ilmiah Anda. Penerbitan ilmiah telah menjadi identik dengan penelitian ilmiah, menyediakan mekanisme untuk berbagi penemuan dan hipotesis serta untuk menginspirasi upaya masa depan

Errata: Evolusi terarah terus-menerus dari sintetase aminoasil-tRNA

Errata: Evolusi terarah terus-menerus dari sintetase aminoasil-tRNA

Artikel asli diterbitkan pada 16 Oktober 2017 Nat. Chem Biol. 13 , 1253-1260 (2017); diterbitkan online 16 Oktober 2017; dikoreksi setelah dicetak 1 Desember 2017 Dalam versi artikel ini yang awalnya diterbitkan, warna label untuk p -NF dan p -IF pada kunci untuk Gambar 4c diubah. Batang cyan harus sesuai dengan p -NF dan batang fuchsia ke p -IF

Corrigendum: Arginine-rhamnosylation sebagai strategi baru untuk mengaktifkan faktor perpanjangan terjemahan P

Corrigendum: Arginine-rhamnosylation sebagai strategi baru untuk mengaktifkan faktor perpanjangan terjemahan P

Artikel asli diterbitkan pada 16 Februari 2015 Nat. Chem Biol. ; doi: 10.1038 / nchembio.1751; dikoreksi online 24 Februari 2015 Dalam versi artikel ini yang awalnya diterbitkan online, inisial tengah penulis kedua secara tidak sengaja dihilangkan. Kesalahan telah diperbaiki untuk versi cetak, PDF dan HTML artikel ini

Corrigendum: Peptida alosterik mengikat zymogen caspase dan memediasi tetramerisasi caspase

Corrigendum: Peptida alosterik mengikat zymogen caspase dan memediasi tetramerisasi caspase

Subjek Skrining obat Mekanisme enzim Penyakit neurodegeneratif Biologi struktural Artikel asli diterbitkan pada 10 Juni 2012 Nat. Chem Biol. 8 , 655–660 (2012); diterbitkan online 10 Juni 2012; dikoreksi setelah cetak 21 Mei 2013 Dalam versi artikel ini yang awalnya diterbitkan, Irina Krylova secara tidak sengaja diakui daripada dimasukkan dalam daftar penulis.