Ulasan genetika (April 2020)

MicroRNAs dalam jaringan Hox: tautan yang jelas ke prevalensi posterior

MicroRNAs dalam jaringan Hox: tautan yang jelas ke prevalensi posterior

Abstrak Faktor transkripsi Homeobox (Hox) memberi koordinat aksial anterior-posterior (AP) ke embrio vertebrata. Gen Hox ditemukan dalam kelompok yang juga mengandung gen untuk microRNAs (miRNAs). Analisis kami terhadap target miRNA yang diprediksi menunjukkan bahwa miRNA Hox yang tertanam di cluster lebih suka menargetkan moxa Hox

Secara singkat

Secara singkat

Layar Genetik Perpustakaan RNAi transgenik lebar genom untuk inaktivasi gen bersyarat di Drosophila . Dietzl, G. et al . Alam 12 Juli 2007 (doi: 10.1038 / nature05954) Makalah ini melaporkan pembuatan dan validasi perpustakaan transgenik skala besar untuk skrining RNAi di Drosophila melanogaster , yang memungkinkan fungsi gen dianalisis di semua jaringan dan tahap perkembangan

Inbreeding dan epigenetik: efek yang menguntungkan sekaligus merusak

Inbreeding dan epigenetik: efek yang menguntungkan sekaligus merusak

Subjek Epigenetik Kawin sedarah Artikel korespondensi oleh Christian Biémont (Biémont, C. Efek inbreeding pada era epigenetik. Nature Rev. Genet. 11 , 234 (2010) 1 dan artikel (Charlesworth, D. & Willis, JH Genetika dari depresi inbreeding. Nature Rev Genet. 10 , 783-796 (2009) 2, 3 ia membahas perlu dialog lebih lanjut.

Rute untuk melanggar dan melindungi privasi genetik

Rute untuk melanggar dan melindungi privasi genetik

Subjek Publikasi dan pengarsipan data Pengurutan DNA Etika Database genetika Artikel asli diterbitkan pada 08 Mei 2014 Nature Reviews Genetics 15 , 409–421 (2014) Dalam artikel di atas, kutipan yang salah diberikan dalam referensi 107. Kutipan tersebut seharusnya: Ayday, E., Raisaro, JL, McLaren, PJ, Fellay, J.

Kontribusi yang diwariskan versus arsitektur genetika

Kontribusi yang diwariskan versus arsitektur genetika

Subjek Genetika penyakit Epidemiologi Variasi genetik Studi asosiasi genome-lebar Sifat kuantitatif yang diwariskan Genomik medis Sequencing generasi berikutnya Kita membaca korespondensi oleh Evans dan Keller (Menggunakan metode heritabilitas yang dipartisi untuk mengeksplorasi arsitektur genetika. Nat

Variasi tingkat mutasi pada eukariota: implikasi evolusioner dari mekanisme spesifik-situs

Variasi tingkat mutasi pada eukariota: implikasi evolusioner dari mekanisme spesifik-situs

Tinjauan Baer et al . “Variasi laju mutasi pada eukariota multiseluler: sebab dan akibat” 1 secara akurat menyampaikan tenor sebagian besar literatur tentang evolusi laju mutasi. Bahkan ketika mengakui bahwa tingkat mutasi dapat bervariasi secara dramatis dari satu situs ke situs lain dalam suatu genom, literatur ini sebagian besar mengabaikan atau meminimalkan karakteristik dan konsekuensi khusus dari mekanisme mutasi spesifik lokasi. Ol

Menilai dan mengelola risiko saat berbagi data varian genetika agregat

Menilai dan mengelola risiko saat berbagi data varian genetika agregat

Subjek Database genetika Variasi genetik Studi asosiasi genome-lebar Artikel asli diterbitkan pada 16 September 2011 Nature Reviews Genetics 12 , 730-736 (2011) Pada artikel di atas, tautan yang salah diberikan untuk GWAS Central. Tautan yang benar seharusnya adalah //www.gwascentral.org. Dalam Kotak Informasi Lebih Lanjut, tautan ke //gwas

Komputasi awan untuk analisis dan kolaborasi data genom

Komputasi awan untuk analisis dan kolaborasi data genom

Subjek Biologi komputasi dan bioinformatika Database genetika Genomik Sequencing generasi berikutnya Data penelitian Artikel asli diterbitkan pada 30 Januari 2018 Ulasan Alam Genetika doi: 10.1038 / nrg.2017.113 (2018) Artikel di atas pada awalnya menyatakan “FireCloud dan CGC mengandalkan AWS dan Google Cloud Platform untuk komputasi dan penyimpanan data.

DNA LCN: bukti tanpa keraguan? - sebuah respons

DNA LCN: bukti tanpa keraguan? - sebuah respons

Dalam artikel McCartney (DNA LCN: bukti tanpa keraguan? Nature Rev. Genet. 9 , 325 (2008)) 1 , dikemukakan bahwa uji coba Omagh telah mengungkap kelemahan serius dalam bukti DNA. Namun, banyak bukti tidak dilaporkan oleh media, juga tidak ada dalam penilaian itu sendiri. Peran ilmuwan adalah untuk memberi nasihat kepada pengadilan dengan tidak memihak tentang arti bukti

Meningkatkan forensik manusia melalui kemajuan dalam genetika, genomik dan biologi molekuler

Meningkatkan forensik manusia melalui kemajuan dalam genetika, genomik dan biologi molekuler

Subjek Bioinformatika Genomik kanker Etika Teknik genetika Genomik Biologi molekuler Ilmu Sosial Teknologi Artikel asli diterbitkan pada 18 Februari 2011 Nature Reviews Genetics 12 , 179–192 (2011) Pada Gambar 3 artikel ini, kotak merah yang mengelilingi mata kedua, ketiga dan keempat pada kolom ketiga diposisikan secara salah.

Tes empiris untuk epistasis komposisi

Tes empiris untuk epistasis komposisi

Subjek Interaksi genetik Variasi genetik Metode statistik Dalam artikel Review-nya (Mendeteksi interaksi gen-gen yang mendasari penyakit manusia. Nature Rev. Genet. 10 , 392-404 (2009)) 1 dan di tempat lain 2 , Cordell berpendapat bahwa tes statistik untuk interaksi adalah penggunaan terbatas untuk menjelaskan epistasis di arti yang lebih biologis dari istilah - yaitu, ketika efek dari varian genetik tertentu ditutupi oleh varian di lokus lain 3, 4 ('epistasis komposisi' 5 )

Memperlakukan proses spesiasi sebagai sifat kompleks

Memperlakukan proses spesiasi sebagai sifat kompleks

Dalam Kotak 4 dari Review 1 mereka , Noor dan Feder mendaftar sepuluh contoh gen yang terlibat dalam membentuk penghalang reproduksi yang dapat mengarah pada peristiwa spesiasi. Para penulis menulis: "... kita bisa terkejut di masa depan karena lebih banyak hambatan dipetakan dan terbukti melibatkan mekanisme seperti dorongan meiotik atau konflik genomik ke tingkat yang lebih besar daripada yang saat ini dihargai" (halaman 858)

Tes asosiasi untuk varian langka: skrining mutasi kontrol kasus

Tes asosiasi untuk varian langka: skrining mutasi kontrol kasus

Subjek Genetika kanker Pengujian genetik Studi asosiasi genome-lebar Varian yang jarang Dua ulasan terakhir, satu di Nature Reviews Genetics dari Bansal et al . (Strategi analisis statistik untuk studi asosiasi yang melibatkan varian langka. Nature Rev. Genet. 11 , 773-785 (2010)) 1 dan satu di tempat lain 2 , memeriksa area yang muncul dari studi asosiasi varian langka

Jawab: Mengenai nilai analisis genotipe – fenotip berbasis haplotype dan pada transformasi data dalam farmakogenetika dan -genomik

Jawab: Mengenai nilai analisis genotipe – fenotip berbasis haplotype dan pada transformasi data dalam farmakogenetika dan -genomik

Saya menyambut komentar Vormfelde dan Brockmöller, yang menurut saya tidak sepenuhnya bertentangan dengan saya tetapi lebih jauh dari yang saya punya ruang untuk dilakukan dalam artikel pengantar saya. Namun, saya ingin mengajukan beberapa peringatan pada pengamatan mereka. Analisis haplotype seringkali dapat memberikan keuntungan dibandingkan dengan menganalisis satu SNP pada suatu waktu, terutama ketika, seperti yang saya catat di halaman 787 dari Review 1 saya, ada beberapa varian fungsional yang terkait erat yang bekerja pada cis .